Genetisk sekvensering och testning Träningskurs

Denna är en praktisk workshop som introducerar grunderna i bioinformatik. Den riktas till personer med grundläggande biologisk bakgrund och kunskap inom molekylärbiologi, som vill lära sig hur man bearbetar och arbetar med biologiska data med hjälp av beräkningsverktyg. Det har särskilt designats för:

• Forskare som arbetar i experimentella laboratorier med biologiska makromolekyler som proteiner, RNA och DNA.
• Vetenskapsmän vars huvudsakliga kompetensområde inte är biologi, men som behöver hantera biologiska data.
• Ledare som introducerar nya produkter (t.ex. läkemedel), som vill utvidga sin kunskap om dagens bioinformatik.
• Dataprogrammerare som ska skriva program som hanterar biologiska molekyler.

Kursen är indelad i två delar: teoretisk och praktisk. Föreläsningen blandas med enkla praktiska övningar, quizar och tester för att säkerställa att deltagarna förstår koncepten.

Under träningen tar vi dig på en guidad runda som täcker alla grundläggande aspekter av biologisk dataanalys. Denna workshop är en idealisk möjlighet att bekanta sig med bioinformatik och dess många ansikten! Till slut ska du kunna hantera vilket grundläggande bioinformatiskt problem som helst: du kommer att veta varifrån du kan hämta de nödvändiga data, hur du erhåller relevant information och hur grundläggande programvara och algoritmer fungerar. Vår målsättning är att underlätta din förståelse av biologiska data.

När kursen är över kommer du kunna arbeta med biologiska data med hjälp av bioinformatiska verktyg.

Godkänt kliniskt arbete (GCP) är en serie riktlinjer för klinisk forskning som utförs på människa. GCP fungerar som det internationella standarden för design, genomförande, övervakning, dokumentering, analys och rapportering av kliniska studier.

I denna instruktörsledda, liveutbildning kommer deltagarna att lära sig de viktigaste riktlinjerna och grundläggande principerna som gäller för Godkänt kliniskt arbete (GCP) vid kliniska studier och forskning som involverar människa. Kursen ger en översikt över de olika GCP-områdena, men fokuserar något mer på ICH-centrerade riktlinjer för undersökande läkemedel och biologiska produkter.

Genom denna utbildning kommer deltagarna att kunna:

• Förstå grundläggande principerna för GCP vid undersökande läkemedel och biologiska produkter baserat på Internationella konferensen om harmonisering (ICH)
• Tillämpa riktlinjerna som ställs upp av GCP i deras kliniska forskningar och studier

Målgrupp

• Kliniska forskare
• Kliniska forskningsprofesionella
• Hälso- och sjukvårdsprofessionella
• Stödpersonnel för kliniska studier
• Forskare och utvecklarpersonal

Kursformat

• Del föreläsning, del diskussion, övningar och intensiv praktisk handledning

Mikrobiell genomik och metagenomik kombinerar sekvenseringstekniker och beräkningsanalys för att profilera mikrobiella samhällen, karakterisera genomer och detektera funktionella egenskaper såsom resistens mot antimikrobiella medel.

Denna instruktörsledda, live-träning (online eller på plats) riktar sig till forskare och bioinformatiker på grundläggande till mellanavancerad nivå som vill utföra praktiska analyser av sekvenseringsdata från mikrobiell genomik och metagenomik.

Vid kursens slut kommer deltagarna att kunna:

• Beskriva vanliga sekvenseringsarbetsflöden och nyckelfiler som används inom mikrobiell genomik.
• Utföra kvalitetskontroll och förbehandling av rå NGS-läsningar.
• Genomföra taxonomisk profilering med markerbaserade och k-mer-metoder.
• Montera och annotera mikrobiella genomer och plasmider.
• Detektera SNP, bygga fylogenier och tolka populationens struktur.
• Prediktera gener för resistens mot antimikrobiella medel och sammanfatta funktionella profiler.
• Använda reproducerbara arbetsflöden med Conda, Docker och noteringbaserade rapporter.

Kursens format

• Föreläsningar som introducerar begrepp och verktyg (20%).
• Praktiska övningar med exempel på datamängder (60%).
• Öppna diskussioner och vägledd analys så att deltagarna kan tillämpa metoder på sina data (20%).

Alternativ för kursanpassning

• För att begära en anpassad workshop som fokuserar på klinisk, miljömässig eller industriell metagenomik, vänligen kontakta oss för att arrangera.

Denna instruktörsvägleda, liveutbildning i Sverige (online eller på plats) är riktad till forskare och alla andra som vill lära sig grunderna i nanovetenskap och dess tillämpningar.

Genom denna utbildning kommer deltagarna att kunna:

• Förstå fältet nanovetenskaper och nanotekniker.
• Kunna skilja mellan objekt i det nanoskalade från de i mikroskalade.
• Känna till den grundläggande teorin för elektron- och energiöverföring.

Detta är en praktisk kurs som visar varför programmering är ett kraftfullt verktyg i samband med att lösa biologiska problem. Under kursen kommer deltagarna att lära sig programmeringsspråket Python, ett språk som allmänt anses vara både kraftfullt och lätt att använda. Denna kurs kan ses som en demonstration av hur bioinformatik förbättrar biologers liv.

Kursen är utformad och riktar sig till personer utan datavetenskaplig bakgrund som vill lära sig programmera.

Denna kurs är lämplig för:

• Forskare som arbetar med biologiska data.
• Forskare som vill lära sig att automatisera vardagliga uppgifter och analysera data.
• Chefer som vill lära sig hur programmering förbättrar arbetsflöden och genomför projekt.

I slutet av kursen kommer deltagarna att kunna skriva korta program, vilket gör det möjligt för dem att manipulera, analysera och hantera biologiska data och presentera resultat i ett grafiskt format.

Detta kurstillfälle syftar till att ge forskare en förståelse för principerna kring statistiskt design och analys samt deras relevans för forskning inom ett brett spektrum av naturvetenskapliga discipliner.

Kurset täcker några sannolikhets- och statistiska metoder, främst genom exempel. Träningen består av cirka 30% föreläsningar, 70% vägledande quizar och laborationer.

I fallet med stängda kurser kan vi anpassa exemplen och materialet till en specifik gren (som psykologiska tester, offentlig sektor, biologi, genetik osv.).

För öppna kurser används blandade exempel.

Även om olika mjukvara används under detta kurs (Microsoft Excel till SPSS, Statgraphics etc...) är dess huvudfokus på att förstå principer och processer som styr forskning, resonemang och slutsatser.

Kurset kan ges som ett blandat kurstillfälle, dvs. med hemuppgifter och uppgifter.