Kursplan

Introduktion till programmeringsspråket Python

  • Varför Python?
  • Att använda Python för att hantera biologiska data
  • Arbeta med iPython-skalet
  • Ditt första program
  • Skriva Python skript
  • Importera moduler

Arbete med protein- och RNA/DNA-sekvenser

  • Att hitta motiv
  • Transkribering och översättning in silico
  • Hantera sekvensjusteringar

Analysera data i olika biologiska format

  • Analysera FASTA
  • Konverteringar av dataformat

Genomföra biologiska analyser

  • SPRÄNGA
  • AccessAnvända biologiska webbtjänster

Hantering av biologiska 3D-strukturer med hjälp av Python

Python Underlättar statistisk analys

Visualisera data

  • Skapa stapel- och punktdiagram
  • Beräkna en area under kurvan (AUC)

Arbeta med .xls och .csv filer

  • Importera data från och exportera till MS Excel / OpenOffice Calc
  • Skriva .xls och .csv filer

Använda Python för att skapa en pipeline för automatiserad databearbetning

Krav

Grundläggande biologisk kunskap om protein, RNA och DNA-sekvenser.

 28 timmar

Antal deltagare



Price per participant

Vittnesmål (1)

Relaterade Kategorier