Kursplan

Introduktion till programmeringsspråket Python

  • Varför Python?
  • Att använda Python för att hantera biologiska data
  • Arbeta med iPython-skalet
  • Ditt första program
  • Skriva Python skript
  • Importera moduler

Arbeta med protein- och RNA/DNA-sekvenser

  • Att hitta motiv
  • Transkribering och översättning in silico
  • Hantera sekvensjusteringar

Tolkning av data i olika biologiska format

  • Tolkning av FASTA
  • Konverteringar av dataformat

Genomföra biologiska analyser

  • SPRÄNGA
  • AccessIng av biologiska webbtjänster

Hantering av biologiska 3D-strukturer med hjälp av Python

Python Underlättar statistisk analys

Visualisera data

  • Skapa stapel- och punktdiagram
  • Beräkna en area under kurvan (AUC)

Arbeta med .xls- och .csv filer

  • Importera data från och exportera till MS Excel / OpenOffice Calc
  • Skriva .xls- och .csv-filer

Använda Python för att skapa en pipeline för automatiserad databehandling

Krav

Grundläggande biologiska kunskaper om protein-, RNA- och DNA-sekvenser.

 28 timmar

Antal deltagare


Price per participant

Vittnesmål (1)

Upcoming Courses