Grunderna i Bioinformatics Träningskurs

Denna instruktörsledda, liveträning i Sverige (online eller på plats) riktar sig till biologer som vill använda Biopython.

I slutet av denna utbildning kommer deltagarna att kunna:

• Integrera biologiska begrepp med informationsteknologi för att lösa forskningsproblem.
• Gruvinformation från stora datamängder av biologiskt ursprung.
• Skapa algoritmer för viktiga forskningsuppgifter.

Denna handledareledd, liveutbildning i Sverige (online eller på plats) riktas till sjukvårdsprofessorer och arbetare som önskar lära sig mellan- till avancerat nivå av kunskap om de olika genetiska sekvenseringss och testningsoperationerna.

När denna utbildning är klar kommer deltagarna att kunna:

• Lära sig och förstå viktiga begrepp inom genetik.
• Förstå hur genetiska sekvenserings- och testningsoperationer fungerar.

Godkänt kliniskt arbete (GCP) är en serie riktlinjer för klinisk forskning som utförs på människa. GCP fungerar som det internationella standarden för design, genomförande, övervakning, dokumentering, analys och rapportering av kliniska studier.

I denna instruktörsledda, liveutbildning kommer deltagarna att lära sig de viktigaste riktlinjerna och grundläggande principerna som gäller för Godkänt kliniskt arbete (GCP) vid kliniska studier och forskning som involverar människa. Kursen ger en översikt över de olika GCP-områdena, men fokuserar något mer på ICH-centrerade riktlinjer för undersökande läkemedel och biologiska produkter.

Genom denna utbildning kommer deltagarna att kunna:

• Förstå grundläggande principerna för GCP vid undersökande läkemedel och biologiska produkter baserat på Internationella konferensen om harmonisering (ICH)
• Tillämpa riktlinjerna som ställs upp av GCP i deras kliniska forskningar och studier

Målgrupp

• Kliniska forskare
• Kliniska forskningsprofesionella
• Hälso- och sjukvårdsprofessionella
• Stödpersonnel för kliniska studier
• Forskare och utvecklarpersonal

Kursformat

• Del föreläsning, del diskussion, övningar och intensiv praktisk handledning

Mikrobiell genomik och metagenomik kombinerar sekvenseringstekniker och beräkningsanalys för att profilera mikrobiella samhällen, karakterisera genomer och detektera funktionella egenskaper såsom resistens mot antimikrobiella medel.

Denna instruktörsledda, live-träning (online eller på plats) riktar sig till forskare och bioinformatiker på grundläggande till mellanavancerad nivå som vill utföra praktiska analyser av sekvenseringsdata från mikrobiell genomik och metagenomik.

Vid kursens slut kommer deltagarna att kunna:

• Beskriva vanliga sekvenseringsarbetsflöden och nyckelfiler som används inom mikrobiell genomik.
• Utföra kvalitetskontroll och förbehandling av rå NGS-läsningar.
• Genomföra taxonomisk profilering med markerbaserade och k-mer-metoder.
• Montera och annotera mikrobiella genomer och plasmider.
• Detektera SNP, bygga fylogenier och tolka populationens struktur.
• Prediktera gener för resistens mot antimikrobiella medel och sammanfatta funktionella profiler.
• Använda reproducerbara arbetsflöden med Conda, Docker och noteringbaserade rapporter.

Kursens format

• Föreläsningar som introducerar begrepp och verktyg (20%).
• Praktiska övningar med exempel på datamängder (60%).
• Öppna diskussioner och vägledd analys så att deltagarna kan tillämpa metoder på sina data (20%).

Alternativ för kursanpassning

• För att begära en anpassad workshop som fokuserar på klinisk, miljömässig eller industriell metagenomik, vänligen kontakta oss för att arrangera.

Denna instruktörsvägleda, liveutbildning i Sverige (online eller på plats) är riktad till forskare och alla andra som vill lära sig grunderna i nanovetenskap och dess tillämpningar.

Genom denna utbildning kommer deltagarna att kunna:

• Förstå fältet nanovetenskaper och nanotekniker.
• Kunna skilja mellan objekt i det nanoskalade från de i mikroskalade.
• Känna till den grundläggande teorin för elektron- och energiöverföring.

Denna instruktörsledda, live genomförda utbildning på Sverige (online eller på plats) vänder sig till avancerade brottsbekämpare, genetiker och antropologer som vill tillämpa NGS-tekniker i brottsutredningar.

Efter avslutad utbildning kommer deltagarna att kunna:

• Förstå principerna för NGS och dess tillämpningar inom brottsbekämpning.
• Analysera DNA-prover från brottsutredningar med hjälp av NGS-tekniker.
• Tolka NGS-data för att identifiera människor och bestämma släktskap.
• Använda NGS för nedbrutna och komplexa DNA-prover.
• Använda bioinformatikverktyg för genomanalys inom brottsbekämpning.
• Förstå juridiska och etiska överväganden inom forensisk genomik.

Detta är en praktisk kurs som visar varför programmering är ett kraftfullt verktyg i samband med att lösa biologiska problem. Under kursen kommer deltagarna att lära sig programmeringsspråket Python, ett språk som allmänt anses vara både kraftfullt och lätt att använda. Denna kurs kan ses som en demonstration av hur bioinformatik förbättrar biologers liv.

Kursen är utformad och riktar sig till personer utan datavetenskaplig bakgrund som vill lära sig programmera.

Denna kurs är lämplig för:

• Forskare som arbetar med biologiska data.
• Forskare som vill lära sig att automatisera vardagliga uppgifter och analysera data.
• Chefer som vill lära sig hur programmering förbättrar arbetsflöden och genomför projekt.

I slutet av kursen kommer deltagarna att kunna skriva korta program, vilket gör det möjligt för dem att manipulera, analysera och hantera biologiska data och presentera resultat i ett grafiskt format.

Denna kurs syftar till att ge forskare en förståelse för principerna för statistisk design och analys samt deras relevans för forskning inom olika vetenskapliga discipliner.

Den täcker viss sannolikhetslära och statistiska metoder, främst genom exempel. Denna utbildning innehåller ungefär 30% föreläsningar och 70% guidade quizzer och laborationer.

I fall av en stängd kurs kan vi anpassa exemplen och materialet till en specifik inriktning (som psykologitester, offentlig sektor, biologi, genetik, etc.).

I fall av offentliga kurser används blandade exempel.

Även om olika programvara används under denna kurs (Microsoft Excel till SPSS, Statgraphics, etc.) är dess huvudfokus att förstå principerna och processerna som styr forskning, resonemang och slutsatser.

Denna kurs kan levereras som en hybridkurs, det vill säga med hemläxor och uppgifter.